參與厭氧氨氧化過程的細菌稱為厭氧氨氧化菌。一般認為厭氧氨氧化菌是自養細菌，以二氧化碳或碳酸鹽作為碳源，以銨鹽作為電子供體，以亞硝酸鹽/硝酸鹽作為電子受體 。

厭氧氨氧化菌(anaerobic ammonium oxidation, Anammox)是一類細菌，屬于浮霉菌門，“紅菌”是業內對厭氧氨氧化菌的俗稱，通過生物化學反應，它們可以將污水中所含有的氨氮轉化為氮氣去除。它們對全球氮循環具有重要意義，也是污水處理中重要的細菌。

厭氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation, Anammox)菌為自養型細菌，可在缺氧條件下以氨為電子供體，亞硝酸鹽為電子受體，產生  。已發現的厭氧氨氧化菌均屬于浮霉狀菌目（Planctomycetales）的厭氧氨氧化菌科（Anammoxaceae），共 6 個屬，分別為 Candidatus Brocadia、Candidatus Kuenenia、Candidatus Anammoxoglobus、CandidatusJettenia、Candidatus Anammoximicrobium moscowii 及 Candidatus Scalindua。其中，Candidatus Scalindua 發現于海洋次氧化層區域，稱之為海洋厭氧氨氧化菌，其余 5 個屬均發現于污水處理系統中，稱之為淡水厭氧氨氧化菌。厭氧氨氧化細菌對全球氮循環具有重要意義，也是污水處理中重要的細菌。文章來源于網絡

厭氧氨氧化菌簡單講解